微波真空干燥机在真空条件下通过空气对流传热难以进行，只有依靠热传导及辐射的方式给物料提供热能，微波真空干燥机被加热物料表面温度高内部温度低，内外温差大，温度难以控制。所以，常规真空干燥方法热的传导速度缓慢、能耗大、效率低、干燥时间长。
微波真空干燥机具有干燥产量高、质量好、加工成本低，同时通过智能化控制系统可以^控制水分等优点。
此外，微波真空干燥机在低温低压下干燥时氧含量低，被干燥物料氧化反应减弱变缓，从而保证了物料的风味、外观和色泽，易于干燥热敏性物料，特别是对中药提取物浸膏、牛肉酱、化工原料、农产品的低温干燥，微波真空干燥机具有其独特的优势。